MongoDB fue fundada en 2007 por Dwight Merriman, Eliot Horowitz y Kevin Ryan, el equipo detrás de DoubleClick.
En la empresa de publicidad en Internet DoubleClick (ahora propiedad de Google), el equipo desarrolló y utilizó numerosos almacenes de datos personalizados para solucionar las carencias de las bases de datos existentes. El negocio servía 400 000 anuncios por segundo, pero a menudo tenía problemas de escalabilidad y agilidad. Frustrado, el equipo halló inspiración para crear una base de datos que abordara los desafíos a los que se enfrentaban en DoubleClick.
Así fue cómo nació MongoDB.